《国家税务总局关于跨地区经营建筑企业所得税征收管理问题的通知》（国税函〔2010〕156号）规定：

　　（一）跨地区建筑业企业所得税征管，依据国税函〔2010〕156号规定处理，建筑企业总机构直接管理的跨地区设立的项目部，应按项目实际经营收入的0.2%按月或按季由总机构向项目所在地预分企业所得税，并由项目部向所在地主管税务机关预缴。

　　以总机构名义进行生产经营的非法人分支机构，无法提供汇总纳税企业分支机构所得税分配表，也无法提供文件规定相关证据证明其二级及以下分支机构身份的，应视同独立纳税人并就地缴纳企业所得税。

　　总机构应当自年度终了5个月内，汇总计算年度应纳所得税额，扣除已预缴的税款，计算出应缴应退税款，分别由总机构和各分支机构就地办理税款缴库或退库。

　　（二）统一计算、分级管理

　　建筑企业所属二级或二级以下分支机构直接管理的项目部不就地预缴企业所得税，其经营收入、职工工资和资产总额应汇总到二级分支机构统一核算，由二级分支机构规定的办法预缴企业所得税。

　　（三）就地预缴、汇算清缴

　　汇总计算的企业所得税，包括预缴税款和汇算清缴应缴应退税款，50%在各分支机构间分摊，各分支机构根据分摊税款就地办理缴库或退库；50%由总机构分摊缴纳，其中25%就地办理缴库或退库，25%就地全额缴入中央国库或退库。(注：以福建为例，省内跨市（县）总分机构按照60%：40%的比例分享。)