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564 为进一步加强我部“中央级科学事业单位修缮购置专项资金”管理，根据财政部《中央级科学事业单位修缮购置专项资金管理办法》（财教[2006]118号）及中央财政项目资金管理有关规定，我们对原《农业部科学事业单位修缮购置专项资金管理实施细则》（农办财[2007]58号）进行了修订，现予印发，请遵照执行。
农业部科学事业单位修缮购置专项资金管理实施细则
第一章 总 则
第一条 为规范和加强“中央级科学事业单位修缮购置专项资金”（简称修购专款）的管理，根据财政部《中央级科学事业单位修缮购置专项资金管理办法》（财教[2006]118号）、中央财政项目资金管理及国有资产管理有关规定，制定本实施细则。
第二条 农业部科学事业单位指中国农业科学院、中国水产科学研究院和中国热带农业科学院（简称三院）及其所属科研机构（不包括已转制机构）。
第三条 修购专款指中央财政在预算内安排用于农业部科学事业单位房屋修缮、基础设施改造、仪器设备购置及升级改造的专项资金。
修购专款支持的项目简称修购项目。项目承担单位简称项目单位。
第四条 修购专款实行项目管理，支持范围包括：
（一）房屋修缮，指连续使用15年以上且已不能适应科研工作需要的房屋及科研辅助设施的维修改造。
（二）基础设施改造，指水、暖、电、气等基础设施的维修改造。
（三）仪器设备购置，指直接为科学研究工作服务的科学仪器设备购置。
（四）仪器设备升级改造，指利用成熟技术对尚有较好利用价值、直接服务于科学研究的仪器设备进行功能扩展、技术升级等工作。
第五条 开支范围：项目单位在项目执行中发生的材料费、设备购置费、劳务费、水电动力费、设计费、运输费、安装调试费及其他在项目执行中发生的必要费用。
不得用于购买小汽车，不得用于与采购进口仪器设备无关的出国费用支出。
第六条 安排使用原则：
（一）科学规划、突出重点。以提高项目单位科技创新能力为核心，改善科研基础条件薄弱环节为重点，区分轻重缓急，统筹规划，合理排序。
（二）整合集成、效益优先。优先支持整合力度大、集成度高、能实现开放和共享、预期效益高的项目。
第二章 职责分工
第七条 财务司职责：
（一）制修订农业部修购专款管理实施细则。
（二）审核报送修购工作规划。
（三）会同科技教育司组织开展项目申报文本等评审工作，并向财政部报送评审结果。
（四）批转年度修购专款预算。
（五）监管修购专款预算执行行为。
（六）组织开展修购专款绩效考评工作。
（七）审核报送修购项目验收总结。
（八）承担修购专款管理的其他工作。
第八条 科技教育司职责：
（一）督导三院编报修购工作规划并汇总送财务司。
（二）审批三院修购项目实施方案。
（三）配合财务司监督检查修购专款预算执行。
（四）指导和监督三院组织实施修购项目。
（五）组织修购项目验收，并将验收总结报告送财务司。
（六）承担在修购项目申报与实施过程中其他与科技教育司工作职责相关的工作。
第九条 三院职责：
（一）组织所属项目单位编报修购工作规划和项目申报文本。
（二）批转年度修购专款预算。
（三）汇总报送项目实施方案。
（四）组织实施修购项目。
（五）配合财务司组织开展修购专款绩效考评工作。
（六）配合科技教育司组织开展修购项目验收。
（七）监督检查本院修购专款预算执行情况。
（八）承担其他相关工作。
第十条 项目单位职责：
（一）项目单位法定代表人对修购项目负有第一责任。
（二）编报修购工作规划和项目申报文本。
（三）编报项目实施方案。
（四）具体组织实施修购项目。
（五）编报修购项目执行报告，提交验收申请。
（六）具体管理本单位修购专款。
（七）承担其他相关工作。
第三章 项目申报
第十一条 项目单位在申报各年度修购项目前，必须提前做好项目可行性研究及必要的勘察、设计、论证、询价等前期工作，房屋修缮类和基础设施改造类项目，还应与当地规划、建设等相关部门沟通一致。
第十二条 科学仪器设备购置须符合事业单位国有资产配置管理相关规定。购置价值超过200万元以上的单台或成套仪器设备，按照《中央级新购大型科学仪器联合评议工作管理办法》（财教[2004]33号）有关规定执行。
第十三条 项目单位应按财政部和农业部统一部署，依据修购工作规划编制各年度《中央级科学事业单位修缮购置项目申报书》，经本单位领导班子集体研究决定后，以正式文件报送本院相关管理部门。项目申报文件中应如实说明前期工作开展情况，并提供相关证明材料。
第十四条 三院对项目单位报送材料的完整性、合规性进行审核后，以正式文件报送财务司。财务司会同科技教育司组织对申报的修购项目进行评审、排序，并据此编制农业部年度《中央级科学事业单位修缮购置项目审核推荐表》，与项目申报文件一并报送财政部。
第十五条 实行项目预算执行进度与下年度项目预算安排挂钩。项目单位的项目预算执行进度情况，作为财务司和科技教育司对申报项目进行评审、排序的重要指标之一。
第四章 项目实施
第十六条 财务司会同科技教育司，依据财政部批复，将年度修购专款预算批转三院，三院据此批转本院各项目单位。
第十七条 项目单位依据财政部下达的修购专款预算控制数，及时编制项目实施方案，报科技教育司审批。
第十八条 项目单位要严格按照规定的开支范围及其他相关财务管理规定使用修购专款，要加强预算执行计划管理，提高财政资金使用效益。
第十九条 项目单位要严格执行政府采购管理有关规定，属于政府采购范围的，应按照《中华人民共和国政府采购法》及有关规定执行。
第二十条 项目单位使用修购专款形成的资产均属国有资产，应按国有资产管理有关规定和事业单位财务会计制度，及时纳入本单位财务账和资产账管理，未经批准不得擅自将产权移交其他企事业单位或转作经营性使用。
第二十一条 项目单位不得擅自变更项目预算内容。确因特殊情况需要进行调整的，应逐级审核后报送财务司，由财务司上报财政部，经财政部批准后方可进行变更调整。
第二十二条 项目单位须按月编报修购项目预算执行情况报表，经本院相关管理部门审核后分别报送财务司、科技教育司，并在年度决算中对修购专款预算执行情况进行单独说明。
第二十三条 项目单位须在实施方案确定的修购项目实施周期终了后1个月内，及时编制项目实施情况报告，经本院相关管理部门审核后报送科技教育司、财务司。其中，已按期完成的项目，须同时提出项目验收申请；未按期完成的项目，须逐项说明理由并提出后续工作措施。
第五章 项目验收和绩效考评
第二十四条 修购项目验收由科技教育司组织。其中，预算金额在200万元以上（含200万元）的项目须经有资质的社会中介机构出具审计报告，审计报告中除载明资金使用情况等常规审计结果外，还应审核编列新增资产数量和价值明细情况。
第二十五条 验收结束后，应及时将验收报告送财务司。其中，通过验收的，由财务司审核后报财政部；未通过验收的，由科技教育司提出整改意见，限期整改后重新验收。
第二十六条 凡有以下情形之一的，不能通过验收：
（一）未按批准的修购项目预算使用资金，或未经批准擅自改变项目预算内容、变更项目资金使用范围的。
（二）所提供的验收文件、资料和数据不真实，存在弄虚作假行为的。
（三）未按国有资产和财务管理有关规定执行，经费使用存在严重问题的。
（四）不应验收通过的其他问题。
第二十七条 修购项目实行追踪问效和绩效考评。财务司依据《中央部门预算支出绩效考评管理办法（试行）》（财预[2005]86号）、《中央级教科文部门项目绩效考评管理办法》（财教[2005]149号）等有关规定，会同科技教育司组织开展部分或全部修购项目的绩效考评。考评结果由财务司报送财政部。
第二十八条 财政部审定批复的修购专款预算，以及农业部批复的实施方案，是项目验收和绩效考评的重要依据。
第二十九条 项目单位要建立修购项目管理档案，对项目申报文件、项目预算批复、项目实施方案、项目实施情况报告、项目验收报告及社会中介机构出具的审计报告等及时归集并实行专门管理。
第六章 监督管理
第三十条 科技教育司负责监督检查修购项目实施情况，财务司会同科技教育司负责监督检查修购专款使用情况、资产入账及管理情况。
第三十一条 修购项目已完成形成的结余资金，项目中止或撤销形成的结余资金，项目连续两年未动用、或者连续三年仍未使用完形成的结余资金，一律核定为净结余资金，由财务司统筹安排支出。
第三十二条 对违反修购专款管理有关规定，弄虚作假、擅自改变资金用途，挤占、挪用或造成资金损失的行为，依法依规严肃查处。
第七章 附 则
第三十三条 本细则未尽事宜，按照财政部、农业部有关规定执行。
第三十四条 本细则由财务司负责解释。
第三十五条 本细则自发布之日起实施。
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境外投资者境内利润再投资税收抵免新政解析
在进一步鼓励境外投资者在华投资，优化稳定外资税收环境的背景下，财政部、税务总局与商务部于2025年6月27日联合发布《关于境外投资者以分配利润直接投资税收抵免政策的公告》(财政部 税务总局 商务部公告2025年第2号，以下简称“2号公告”)，该公告自2025年1月1日起施行。
为推动该政策有效落地，2025年7月起，各相关部门密集发布配套文件，包括国家发展改革委等七部门印发的《关于实施鼓励外商投资企业境内再投资若干措施的通知》(发改外资[2025]928号，以下简称“928号通知”)、商务部发布的《关于做好境外投资者以分配利润直接投资税收抵免政策落实工作的通知》(商办资函[2025]380号，以下简称“380号通知”)，以及国家税务总局发布的《关于境外投资者以分配利润直接投资税收抵免政策有关事项的公告》(国家税务总局公告2025年第18号，以下简称“18号公告”)。上述举措充分体现出我国对鼓励境外投资者在华持续投资的政策支持力度。本文拟梳理境外投资者境内利润再投资相关的税收政策，从符合新政条件的再投资的合规要点、操作流程及监管特征三个方面进行分析。本文拟从新政适用条件、操作流程管理及合规要点三个维度，梳理境外投资者适用税收抵免政策的关键考量，以协助企业在享受优惠的同时有效防范风险。
一、境外投资者境内利润再投资的税收政策
(一)税收抵免政策新政：可叠加适用原有递延纳税政策
现行《企业所得税法》规定，非居民企业取得来源于中国境内的股息、红利等权益性投资收益，适用源泉扣缴制度，按10%的税率，或依据税收协定适用优惠税率征收预提所得税。
为鼓励境外投资者持续在华投资，自2017年1月1日起，我国已实施境外投资者境内利润再投资递延纳税政策，即对符合条件的境内再投资暂不征收预提所得税(下称“递延纳税政策”)。而根据2025年1月1日起施行的2号公告，符合条件的境外投资者通过境内利润直接用于再投资的，可以按投资额的10%或税收协定规定的更低税率，自境外投资者当年应纳税额中抵免，未抵完部分可结转以后年度继续抵免(下称“税收抵免政策”)。新出台的税收抵免政策为阶段性政策，执行期间为2025年1月1日至2028年12月31日，可与原有递延纳税政策叠加适用。
(二)税收抵免政策的适用条件
虽然税收抵免政策可以与现行的递延纳税政策叠加适用，但两者在适用条件上并不完全一致。2号公告对税收抵免政策的适用条件作出了系统规定，18号公告则对执行层面的关键问题进行了进一步明确。为更准确把握该政策的适用范围，本文将结合递延纳税政策，从适用条件的异同角度，对税收抵免政策的具体要求进行梳理与分析。
| 适用条件 （同时满足） | 税收抵免政策 | 递延纳税政策 | 异同 |
| 境外投资者 | 适用《企业所得税法》第三条第三款的非居民企业，即在中国境内未设立机构、场所的，或者虽设立机构、场所但取得的所得与其所设机构、场所没有实际联系的，应当就其来源于中国境内的所得缴纳企业所得税。（排除设立机构、场所/常设机构或与此相关的所得） | 适用《企业所得税法》第三条第三款的非居民企业，即在中国境内未设立机构、场所的，或者虽设立机构、场所但取得的所得与其所设机构、场所没有实际联系的，应当就其来源于中国境内的所得缴纳企业所得税。（排除设立机构、场所/常设机构或与此相关的所得） | 相同 |
| 利润分配企业 | 中国境内居民企业（在中国境内成立） | 中国境内居民企业（在中国境内成立） | 相同 |
| 分得的利润 | 中国境内居民企业向投资者实际分配的留存收益而形成的股息、红利等权益性投资收益 | 中国境内居民企业向投资者实际分配已经实现的留存收益而形成的股息、红利等权益性投资收益 | 相同 |
| 可抵免的应纳税额 | 从利润分配企业自利润分配再投资之日以后取得的《企业所得税法》第三条第三款规定的股息红利、利息、特许权使用费等所得应缴纳的企业所得税 | 不适用 | 不适用 |
| 投资方式 | 境内直接投资，包括境外投资者以分得利润进行的增资、新建、股权收购等权益性投资，但不包括新增、转增、收购上市公司股份（符合条件的战略投资除外），具体包括1.新增或转增中国境内居民企业实收资本或者资本公积（包括补缴已认缴的注册资本）；2.在中国境内投资新建居民企业；3.从非关联方收购中国境内居民企业股权。 | 直接投资，包括境外投资者以分得利润进行的增资、新建、股权收购等权益性投资行为，但不包括新增、转增、收购上市公司股份（符合条件的战略投资除外），具体包括1.新增或转增中国境内居民企业实收资本或者资本公积（包括补缴已认缴的注册资本）；2.在中国境内投资新建居民企业；3.从非关联方收购中国境内居民企业股权；4.财政部、税务总局规定的其他方式。 | 相同 |
| 被投资企业的产业 | 《鼓励外商投资产业目录》内产业 [1] | 无 | 更为严格 |
| 分配利润的支付形式 | 现金形式支付（直接转入）和非现金形式支付（资产所有权直接转入） | 现金形式支付（直接转入）和非现金形式支付（资产所有权直接转入） | 相同 |
| 持股时限 | 连续持股5年（60个月）以上 | 无 | 更为严格 |
| 执行期限 | 2025年1月1日至2028年12月31日 | 暂无明确期限 | 阶段性 |
18号公告进一步明确了税收抵免政策的执行细节，包括：
(一)明确补缴已认缴注册资本增加实收资本或资本公积属于符合条件的直接投资方式，使得税收抵免政策与递延纳税政策在投资方式适用范围上一致。
(二)鉴于税收抵免政策对境外投资者再投资有5年(60个月)的持股期限要求，18号公告明确了再投资开始和停止的时间，开始时间以商务主管部门出具的《利润再投资情况表》中列明的再投资时间当月，停止时间以收回投资款与被投资企业按规定完成法律形式变更手续月份中较早的月份为准。
(三)明确了抵免额度的计算细节：境外投资者可在计算抵免额度时自主选择10%的法定预提税率或较低的协定税率，但在未来收回投资并补缴递延税款时，不得适用较低的协定税率;若利润来源于多个企业，应按各利润分配企业分别归集计算抵免额度;如使用外币进行再投资，应以实际支付日的汇率中间价折算确定抵免额度。值得留意的是，如果计算抵免额度时选择协定优惠税率，但是之后被税务机关认定不符合协定待遇条件的，可以调增抵免额度。
(四)如不符合税收抵免政策条件(包括未满足5年持股期限)但实际享受抵免政策导致少缴税款的，境外投资者除应补缴相应税款，并自其实际抵减应纳税额之日起加收滞纳金。
二、税收抵免政策的程序性要求
结合2号公告、380号通知和18号公告，适用税收抵免政策的操作流程及程序性要求如下：
(一)境外投资者自行判断适用条件
境外投资者应根据自身情况，判断是否符合税收抵免政策的适用条件，并明确再投资的基本信息(包括选择用于计算抵免额度的适用税率)。
(二)被投资企业向商务主管部门报送再投资信息
被投资企业应通过商务部业务系统统一平台，向所在地商务主管部门报送相关再投资信息。
(三)商务主管部门核实并出具《利润再投资情况表》
所在地商务主管部门对报送信息进行核实后，报送省级商务主管部门，由其会同财政、税务等相关部门确认，并出具《利润再投资情况表》。
(四)境外投资者填写税收抵免信息报告表
境外投资者应填写18号公告附件中的《境外投资者再投资税收抵免信息报告表》，并提供给利润分配企业。
(五)利润分配企业办理税收抵免手续
利润分配企业在办理扣缴企业所得税申报时，申报抵减境外投资者应缴纳的企业所得税，并填写和/或提交相关材料，尤其包括：《中华人民共和国扣缴企业所得税报告表》;《境外投资者再投资税收抵免信息报告表》(由境外投资者提供);《利润再投资情况表》(商务主管部门出具，见步骤3)。
(六)境外投资者收回投资时的税务处理
再投资满5年(60个月)的，境外投资者应在收回投资后7日内，向利润分配企业所在地税务主管机关申报补缴递延的税款;再投资不满5年(60个月)的，境外投资者除上述补缴递延税款之外，应重新计算抵免额度，对已抵免税额超过抵免额度的，应同时补缴超出抵免额度的税款并加收滞纳金。
(七)被投资企业向商务主管部门报送投资收回信息
在境外投资者收回投资时，被投资企业应通过商务部业务系统统一平台账户，向所在地商务主管部门报送相关信息。
(八)商务主管部门汇总确认与信息共享
所在地商务主管部门核实回收信息后，报送省级商务主管部门确认。省级商务主管部门应按季度将信息与统计、财政、税务等部门共享，并统一上报商务部。
三、适用税收抵免政策时应关注的合规要点
相较于现有的递延纳税政策，税收抵免政策在优惠力度上对境外投资者更为有利，但同时对其适用条件和后续监管提出了更高要求。若适用不当，不仅需补缴税款，还可能加收滞纳金并承担相应法律责任。因此，在适用该政策时，应特别关注以下合规要点：
(一)把握关键时间节点，准确判断适用条件。2号公告虽未限制境内利润产生和分配年份，但再投资应发生在2025年1月1日至2028年12月31日期间;此外，可用于抵免的应纳税额应对应于再投资发生之后取得的所得，且最早不超过2号公告发布之日(即2025年6月27日);关于持股期限的计算，则应严格按照18号公告明确的开始时间和停止时间确认。
(二)合理选择适用税率，平衡短期与长期利益。境外投资者可在抵免额度计算时选择10%的法定预提税率或适用的协定优惠税率，但由于选定后，在未来收回投资并补缴递延税款时不得再适用协定税率。因此，应综合考虑将来可抵免的应纳税额高低、现金流影响及长远税收安排，谨慎作出选择。
(三)持续关注产业政策变化的影响。如被投资企业的产业类型或所依据的鼓励类目录发生变化，是否影响税收抵免政策的税收待遇，境外投资者应密切关注相关政策调整并评估其对税收待遇的影响。
(四)妥善处理投资收回时的政策叠加适用问题。在一项再投资同时符合税收抵免政策与递延纳税政策适用条件的情况下，收回投资时应同步评估两项政策的适用后果，并分别按照相关规定进行税务处理，防止出现合规疏漏。
综上，税收抵免政策在适用条件判定、信息报送、资料准备和操作流程等方面均提出了更高的合规要求。境外投资者及相关境内企业(包括被投资企业、利润分配企业及其他扣缴义务人)应确保各环节操作规范、材料完备，建立有效的内部审查和存档机制，并在有疑问时及时咨询专业人士，以防范税务与合规风险。
提示：[1] 现行有效的适用文本为《鼓励外商投资产业目录(2022年版)》(国家发展和改革委员会、商务部令第52号)。
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