不少老板在创业初期经常遇到这个问题：目前自己有一家公司，后期想发展壮大、发展的各店面整体由总公司管理，听闻设立成总分公司刚好适用此业务模式，干脆直接成立若干个分公司，于是老板起草了发展的广阔蓝图、对于经营管理也是游刃有余，但在注册时工作人员或财务提出：您选择“独立核算”还是“非独立核算”？老板蒙了，这中间有什么区别？问财务，财务也一脸懵，实务中发现众多会计都一知半解。

今天就为大家进行解析：

一、会计层面

“独立核算”、“非独立核算”两个名词中都含有“核算”一词，那么大家一看就明白，只有会计范围才涉及核算，如果分公司的业务可以对外自行开展业务、有自己的规章制度、配备一定的财务人员并单独核算，应选择“独立核算”；如果设立的分公司仅仅为一个办事处、相当于分开的一个部门，无法独立入账，所有业务需要到总公司报帐，则选择“非独立核算”。

二、税务层面

主要从以下两大税种分析：

1.增值税

一般来讲，分公司不论是否独立核算，均应由分公司自行申报并缴纳增值税，实务中很多财务混淆概念，一部分分公司的收入未直接由分公司申报，而由总公司汇总缴纳，这种认识是错误的，近期很多区域税务局均要求企业进行自查、纠正；

当然，部分分公司增值税可以由总公司汇总缴纳，具体文件号见财税2012年9号、财税2016年36号文规定，属于固定业户的试点纳税人，总分支机构不在同一县（市），但在同一省（自治区、直辖市、计划单列市）范围内的，经省（自治区、直辖市、计划单列市）财政厅（局）和国家税务局批准，可以由总机构汇总向总机构所在地的主管税务机关申报缴纳增值税，当然审批条件也是比较严苛的。

2.企业所得税

分公司设立的其中之一目的为总分机构的所得税可以进行互相调节，政策规定分机构的企业所得税汇总到总公司进行缴纳，具体参照国家税务总局公告2012年57号规定，实务中很多企业也是未将总分公司的所得税进行汇总申报，存在一定的税务风险。

综上所述，企业可根据业务自行选择“独立核算”、“非独立核算”，主要看业务形态及是否可以独立记账，但两者在税务层面没有区别。